體外診斷是指在人體之外,通過對人體樣本(血液、體液、組織等)進行檢測而獲取臨床診斷信息,進而判斷疾病或機體功能的產品和服務。而檢測人體樣本的關鍵步驟之一,即是樣本中的核酸(DNA和RNA)純化。核酸提取純化的方法是影響所提取核酸質量的重要因素,只有高質量的核酸才能滿足下游的各種應用。
核酸是分子生物學的基礎,而核酸提取是核酸檢測乃至于整個分子行業繞不過去的門檻,很多時候一份樣本的核酸提取的好壞直接決定了檢測結果的有效性。核酸提取為大量廣泛研究和應用提供了答案(如克隆、qRT-PCR和全基因組、轉錄組范疇中的二代測序技術),獲得的核酸可以多種方式進行應用。
準確的研究目的決定了要提取的核酸類型;核酸的應用往往影響提取方法的選擇。為確定理想的研究方法,有必要清楚了解核酸的下游應用以及任何與樣品類型相關的潛在限制(如臨床樣品采集量往往有限,核酸提取存在挑戰)。
雖然依據樣品類型,細胞裂解方式不同,但整體的核酸提取核心原則不變:細胞或組織樣品裂解,去除非核酸污染物(蛋白質等等)。
核酸提取純化的主要原則和要求如下:
1.保證核酸一級結構的完整性;
2.排除其它分子的污染(如提取DNA時排除RNA的干擾);
3.核酸樣品中不存在對酶有抑制作用的有機溶劑和過高濃度的金屬離子;
4.其它生物大分子如蛋白質、多糖和脂類分子的污染應降到低程度;
5.排除其它核酸分子的污染,如提取DNA分子時應去除RNA,反之亦然。